2014年9月，武昌理工学院与武汉工程大学联合培养硕士研究生，这也是湖北民办高校首批硕士研究生。武汉工程大学负责研究生的招生录取、学籍与档案管理、毕业证和学位证审核发放、毕业就业派遣。对联合培养的硕士研究生实行“三导师制”，第一导师为武昌理工学院导师，第二导师为武汉工程大学导师，第三导师为企业导师。学制为二年半。前一学年，在武汉工程大学完成相关学位课程的学习，且同时进入武昌理工学院实验室开展学位论文相关的部分研究工作，后一年半在武昌理工学院完成专题学习和硕士学位论文研究。

　　“学校对研究生的培养非常重视，资助力度也很大，导师能力强，两年多的学习让我们收获很多。”四名研究生之一的吴娜告诉记者。短短两年的时间里，4名硕士研究生都有论文发表。吴娜和另外一名研究生李丽还分别获得了国家发明专利。